基于群体资源的单样本肿瘤亚克隆重构算法 背景介绍 癌症的进化过程和肿瘤的基因异质性是现代肿瘤学研究的重要领域。肿瘤从正常细胞进化而来，通过获得体细胞突变逐步发展。这些突变受细胞染色质结构和内源性及外源性诱变压力的影响，以概率的方式发生。如果特定的突变为细胞提供了选择优势，其后代细胞可以在其局部环境中扩展。经过多年的积累，最终形成带有多种癌症标志的细胞群体，即克隆。不同的肿瘤细胞亚群（亚克隆）可以通过漂移或选择压力在整个细胞群体中出现。这种进化特征对临床具有重要意义，基因异质性与较差的预后、更多的突变和耐药性有关。因此，理解和量化肿瘤的进化过程对于癌症治疗和预后评估至关重要。 肿瘤亚克隆重构是一种常见的方法，通过利用体细胞单核苷酸变异（SNVs）和拷贝数异常（CNAs）的等位基因频率来量化肿瘤...
中枢神经系统（CNS）自身免疫性疾病，如视神经脊髓炎谱系疾病（NMOSD），是一种以视神经炎和脊髓炎复发为特征的炎症性自身免疫脱髓鞘疾病。尽管在NMOSD的治疗方面取得了重大进展，但仍有部分患者对现有疗法反应不佳，病情反复且难以治愈。这可能是因为当前的治疗方法未能有效针对CNS内在的免疫失调。抗水通道蛋白4（AQP4）免疫球蛋白G（IgG）通过多种途径引发CNS脱髓鞘损伤，包括抗体依赖性细胞介导的细胞毒性和补体依赖性细胞毒性。 嵌合抗原受体（CAR）T细胞治疗在长期控制血液癌症方面显示出潜力，并在某些难治性自身免疫疾病的治疗中初步显示了疗效。然而，CAR T细胞在自身免疫疾病中的作用机制尚不清楚。本文研究旨在通过对接受抗B细胞成熟抗原（BCMA）CAR T细胞治疗的NMOSD患者进行单细胞多...
氧化磷酸化调节B细胞效应细胞因子并促进多发性硬化中的炎症反应 背景介绍 近年来，B细胞在健康和疾病状态下的抗体独立功能已成为研究热点，尤其是其分泌不同细胞因子的能力，这些因子可以激活或下调局部免疫反应。研究表明，B细胞细胞因子失调是多种免疫介导疾病的病因之一，包括多发性硬化症（Multiple Sclerosis，MS）。然而，目前对B细胞细胞因子表达调控机制的了解仍然有限。本文探讨了促炎性（如GM-CSF表达）和抗炎性（如IL-10表达）B细胞细胞因子的分泌如何被调控，特别是氧化磷酸化（Oxidative Phosphorylation，OxPhos）在其中的作用。 研究来源 这项研究由Rui Li及其团队完成，作者分别来自宾夕法尼亚大学、福建医科大学附属第一医院、哈尔滨医科大学等机构，研...
核苷碱基加成物结合MR1并刺激MR1限制性T细胞 摘要 本文概述了Vacchini等人关于MR1限制性T细胞（MR1T细胞）的最新研究成果，该研究发现了核糖核酸碱基加成物作为MR1T细胞抗原的存在，并揭示了它们在肿瘤细胞中的代谢路径和生理功能。研究成果对于理解MR1T细胞在生理和病理条件下的作用及其治疗潜力具有重要意义。 研究背景 MR1T细胞是一种新发现的T细胞亚群，它们能够识别由MR1分子呈递的自体抗原，而不依赖于微生物感染。当前，MR1T细胞的自体抗原性质尚未明确，这阻碍了我们对其生理作用和治疗潜力的理解。本研究通过结合基因、药理学和生化方法，揭示了MR1T细胞如何监测目标细胞中的代谢变化，为MR1T细胞的功能性研究提供了重要线索。 论文信息 本研究发表于2024年5月10日的《Sci...
TREM2缺陷重塑肠道巨噬细胞与微生物群 以增强抗PD-1肿瘤免疫治疗 华盛顿大学医学院的研究团队，由Blanda Di Luccia等多名科学家领衔，日前在《Science Immunology》杂志上发表了一项研究论文，揭示了肠道微生物群及肿瘤相关巨噬细胞如何影响抗PD-1免疫检查点阻断治疗的研究成果。研究证实，通过阻断或删除巨噬细胞上的触发性受体TREM2，能够增强机体抗肿瘤T细胞应答，并揭示了TREM2缺陷小鼠在抗PD-1治疗后，肠道巨噬细胞向促炎状态的转变，及肠道微生物群中鲁米诺考古菌（Ruminococcus gnavus）的扩展。 研究背景 免疫检查点抑制剂（CPIs）通过阻断PD-1、PD-L1和CTLA-4等蛋白质已在治疗多种癌症中取得成功，但尚有相当数量的患者未能持久响应...
免疫球蛋白超家族配体 B7H6 使 T 细胞反应受 NK 细胞监视 背景介绍 在免疫学领域中，理解调控 T 细胞免疫的机制对于开发针对 T 细胞功能失调相关疾病（如自身免疫性疾病、慢性感染和癌症）的有效疗法至关重要。T 细胞在病毒感染、肿瘤和自身免疫中介导特异性免疫反应，并在抗原识别后经历严格调控的扩增和持久性。抑制性免疫细胞（如 T 调节细胞和某些髓系细胞）可以上调检查点分子或抑制性细胞因子，从而减弱 T 细胞反应以维持体内稳态和自我耐受。然而，T 细胞激活的失调会导致 T 细胞驱动的自身免疫或对肿瘤的无效免疫反应。 研究来源 这篇研究文章由 Michael Kilian、Mirco J. Friedrich、Kevin Hai-Ning Lu 等多位研究人员共同撰写，他们分别来自德国癌症...
研究助力免疫神经炎症治疗的重大突破 背景介绍 类固醇抵抗性是许多炎症性疾病治疗中的重大挑战，特别是自体免疫神经炎症（autoimmune neuroinflammation）。在这些疾病中，TH17 细胞（T helper 17 cells）被广泛认为是导致类固醇抵抗的重要因素；然而，其背后的机制仍未被完全理解。目前的研究集中在实验性自身免疫性脑脊髓炎（Experimental Autoimmune Encephalomyelitis, EAE）动物模型中，该模型被广泛用于研究中枢神经系统（CNS）炎症的免疫病理机制。本文研究的核心问题在于：IL-1β和STAT5信号通路是否是TH17细胞介导的类固醇抵抗的重要机制，并探讨这种机制的治疗意义。 研究来源 这篇论文由William A. Mil...
免疫检查点抑制剂（ICIs，也称为免疫检查点阻断剂）是近年来在癌症免疫治疗中取得重大突破的一类药物。这类药物主要通过阻断程序性死亡蛋白1（PD-1）和细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4），从而激活抗肿瘤T细胞反应。然而，现有的ICIs疗法的总体响应率仍然较低，因此迫切需要寻找新的免疫检查点作为治疗靶点。最近的研究已确立了“干细胞样”肿瘤特异性CD8+ T细胞在响应ICIs疗法中的重要作用，这些细胞通过退出静息状态并经历增殖爆发来发挥功能。但维持这些“干细胞样”T细胞静息状态的机制尚不明确，可能是当前免疫疗法临床抗性的潜在原因。 V-Domain Ig Suppressor Of T Cell Activation（俗称VISTA）是一种B7家族的免疫检查点蛋白，被认为是下一代免疫疗法...
Nudcd3的缺失对V(D)J重组的影响 在先天性免疫缺陷的研究中，特别是T细胞发育异常这一领域，找出关键基因和路径具有重要意义。其中，重度联合免疫缺陷症（SCID）和Omenn综合症（OS）的研究显示出T细胞受体（TCR）重排和信号传导、以及在T淋巴细胞发育过程中通过白介素7受体（IL-7R）传递的存活信号的关键作用。然而，目前对这些病症的基因机制还不完全清楚，尚有许多未知基因可能参与其中。因此，陈等人（Chen et al.）进行了一项深入研究，旨在明确一个新的基因Nudc domain-containing 3（Nudcd3）在SCID和OS中的作用。 研究背景和目的 SCID和OS是两种严重的、威胁生命的免疫缺陷病症，患者对感染具有极高的易感性。SCID通常表现为完全缺乏T和B细胞，...
背景介绍 免疫系统在应对病毒感染中发挥着至关重要的作用，其中T细胞记忆在二次免疫反应中尤为重要。本文聚焦于皮肤感染后如何形成淋巴结中的驻留记忆T细胞（LN TRMs）。LN TRMs在特定部位的免疫记忆中起到关键作用，但它们在病毒感染后的具体形成机制仍不完全清楚。本研究旨在探究抗病毒CD8+ T细胞在疫苗接种引起的皮肤感染模型中如何在皮肤和LN中定位及形成驻留记忆T细胞。 研究来源 本研究由Taylor A. Heim、Austin C. Schultz、Ines Delclaux、Vanessa Cristaldi、Madeline J. Churchill、Katherine S. Ventre、Amanda W. Lund等人完成，作者隶属于纽约大学格罗斯曼医学院皮肤病学系、俄勒冈健康...