Neurohackademy：线上与线下结合的神经信息学教育 背景介绍 近年来，人类神经科学进入了一个大数据时代，由于人类连接组计划（Human Connectome Project）、青少年脑认知发育（ABCD）研究等项目科学家们获取了以前难以想象的规模和范围的数据集。这些数据集对于基础和临床研究都有重要的科学潜力。然而，这些数据集也给研究人员带来了各种新的挑战，包括生成、处理、访问、分析和理解这些数据的挑战。其中一个主要挑战是所谓的“大数据技能差距”：使用这些数据集的研究项目需要不同的知识基础和技能集，以及不同于传统小规模实验研究的技术和概念工具。 研究及文章来源 该研究由Ariel Rokem 和 Noah C. Benson共同完成，均为华盛顿大学 eScience Institut...
光学自旋轨道耦合的宽带色差空间微分成像 背景介绍 在图像处理中，传统的空间微分通常是通过数字电子计算来完成的。然而，许多大数据应用需要实时和高通量的图像处理，这对数字计算来说是一个巨大的挑战。光学模拟空间微分有可能克服这一挑战，因为它能够以低能耗对整个图像进行大规模并行处理。此外，光学空间微分还可以对纯相位物体（如透明的生物细胞）进行成像，这是数字电子计算所无法实现的。因此，光学微分最近受到了广泛关注，在无标签细胞成像、图像处理和计算机视觉等领域有着广泛的应用。 论文来源 这篇论文题为《spin–orbit optical broadband achromatic spatial differentiation imaging》, 由Hongwei Yang、Weichao Xie、Huif...
胃癌及胃食管结合部腺癌中Claudin 18.2的研究报告 背景介绍 胃癌及胃食管结合部（G/GEJ）腺癌是全球范围内的一大健康负担。据估计，仅在2020年，全球新发胃癌和食管癌病例数约为170万，相关死亡人数达到130万。在美国，预计2023年新发胃癌及相关癌症病例48060例，死亡人数为27250。当前，治疗G/GEJ腺癌的选择有限，远处扩散病例的五年相对生存率自2007年以来一直保持在10%左右。因此，迫切需要更好地理解疾病特征、发现新的生物标志物以及了解临床和肿瘤相关特征对诊断、管理和预后的影响。 Claudin（Claudin，CLDN）家族的跨膜蛋白至少包含27种独特的蛋白质，这些蛋白质在正常和癌变组织中有着独特的表达模式。Claudin 18.2（CLDN18.2）在胃粘膜中存...
肿瘤突变负荷预测一线免疫检查点抑制治疗在转移性黑色素瘤中的真实世界结局的研究 转移性黑色素瘤的治疗近年来受到了免疫检查点抑制剂（ICIs）的重大影响。然而，尽管ICIs显著改善了黑色素瘤患者的生存率，其短暂的反应和免疫相关毒性仍然是临床上的限制因素。了解并发现能够预测ICIs治疗效果的生物标志物因此成为了一个重要的研究方向。在各种预测生物标志物中，肿瘤突变负荷（Tumor Mutational Burden, TMB）作为ICI治疗转移性实性癌症的预测分子标志物已经被验证和批准。TMB被定义为每百万碱基对的体细胞突变数量，与患者对ICI检查点抑制剂的反应之间存在相关性。依据这一概念，TMB被假设为免疫原性新抗原的数量与TMB成正比。ICI疗法能够增强或恢复对这些免疫原性新抗原的潜在免疫反应。...
Regorafenib在BRAF突变实体肿瘤患者中的应用：TAPUR研究结果总结 背景介绍 BRAF基因属于细胞质丝氨酸-苏氨酸激酶家族，通过激活丝裂原活化蛋白激酶信号通路（MAPK），调节细胞增殖和存活。BRAF突变可导致其异常活化，促进肿瘤生成。BRAF突变分为三类：I类为V600位点突变，Ras非依赖性激活单体；II类突变为Ras非依赖性激活二聚体；III类是激酶缺陷性突变，促进CRAF激活。BRAF突变常见于黑色素瘤（约40%）、甲状腺癌、结直肠癌（CRC）、非小细胞肺癌（NSCLC）和胆管癌。 Regorafenib是一种小分子多靶点酪氨酸激酶抑制剂，能靶向ABL、DDR2、EGFR、EPHA2、FGFR、KIT、PDGFR、PTK5、RAF、RET、SAPK2、TIE2、TRKA...
在当今的肿瘤学临床实践和药物开发领域，对肿瘤反应的评估方法正处于革新的边缘。自1981年世界卫生组织(WHO)提出用于评估抗癌药物效果的肿瘤反应分类标准以来，这一领域经历了多次改进。最为人们熟知的，是1995年成立的响应评估标准在实体瘤(RECIST)工作组。该工作组通过与加拿大国家癌症研究所、美国国家癌症研究所以及欧洲癌症研究和治疗组织的合作，建立了基于大量病例数据的循证推荐，推动了RECIST 1.0和1.1版本的发布，这些版本在确定客观响应率等影像学终点方面发挥了重要作用。 然而，随着对肿瘤生物学更深入的理解和诊疗策略的不断演进，传统的依赖大小和数量变化的评估方法显示出其局限性，这就需要新的方法来填补这一空缺。为此，RECIST工作组于2022年5月组织了一次多学科工作坊，聚焦于探讨放...
对前列腺癌患者进行转录组分析：基于前列腺特异膜抗原正电子发射断层扫描/计算机断层扫描的非局限性疾病研究 学术背景 前列腺癌是一种常见的男性恶性肿瘤，其诊断和治疗对患者的预后至关重要。转录组分析是一种用于了解基因表达水平的技术，近年来被广泛应用于癌症研究中。Decipher基因分类器是一种预后生物标志物，用于估计前列腺癌患者根治性手术（RP）或放射治疗后的转移风险。当前研究的兴起源自于对Decipher测试在前列腺特异膜抗原正电子发射断层扫描/计算机断层扫描（PSMA PET/CT）时代的预后能力的兴趣。鉴于PSMA PET/CT在检测非局限性疾病方面的高特异性和灵敏性，研究者们希望通过这一先进的分子成像技术，评估Decipher评分与非局限性疾病检测之间的关系。 研究来源 这项研究由John...
Erdafitinib在FGFR突变或融合肿瘤患者中的疗效研究 本篇学术报告基于科学论文《Phase II Study of Erdafitinib in Patients with Tumors with Fibroblast Growth Factor Receptor Mutations or Fusions: Results from the NCI-MATCH ECOG-ACRIN Trial (EAY131) Subprotocol K2》，介绍了该研究的学术背景、目的、方法、结果和结论。 学术背景 成纤维细胞生长因子受体（FGFR）家族包含四种跨膜受体酪氨酸激酶（FGFR1-4），这些受体被超过20种已知的成纤维细胞生长因子（FGF）配体激活，启动信号级联反应，对细胞增殖、生存...
研究背景 近年来，聚ADP-核糖聚合酶（Poly ADP-ribose Polymerase, PARP）抑制剂作为治疗遗传性乳腺癌1/2（BRCA1/2）突变癌症的重要方法，展现出显著疗效。然而，针对ATM、CDK12、CHEK2等其他同源重组缺陷（Homologous Recombination Deficiency，HRD）基因突变的肿瘤，其疗效却不尽人意。因此，研究者们开始探索通过将PARP抑制剂与其他药物联合使用，以增强治疗效果并延长DNA损伤修复的抑制时间。 在以前的一些临床前研究中，PARP抑制剂与拓扑异构酶I抑制剂如伊立替康（Irinotecan）的联合使用显示了明显的协同效应。伊立替康及其活性代谢产物SN-38能够干扰DNA拓扑异构酶I-DNA复合物，从而阻止DNA链的修复...
Phase II Study of Erdafitinib in Patients with FGFR Amplifications: A Detailed Report 背景介绍 成纤维细胞生长因子受体(Fibroblast Growth Factor Receptor, FGFR)家族的信号通路紊乱已经被广泛认为与癌症的发生、进展以及对治疗的耐药性有关。该研究主要探讨了FGFR1-4放大（FGFR amplifications)的肿瘤，尽管FGFR抑制剂已经被批准用于携带FGFR重排或基因突变的特定类型肿瘤，FGFR基因的扩增却是最普遍的。鉴于此，研究旨在评估口服FGFR1-4抑制剂erdafitinib在携带FGFR1-4扩增的肿瘤患者中的抗肿瘤效果。 研究来源 本文由Jun Gong...