在线与线下结合的神经信息学教育:Neurohackademy的经验教训

Neurohackademy:线上与线下结合的神经信息学教育 背景介绍 近年来,人类神经科学进入了一个大数据时代,由于人类连接组计划(Human Connectome Project)、青少年脑认知发育(ABCD)研究等项目科学家们获取了以前难以想象的规模和范围的数据集。这些数据集对于基础和临床研究都有重要的科学潜力。然而,这些数据集也给研究人员带来了各种新的挑战,包括生成、处理、访问、分析和理解这些数据的挑战。其中一个主要挑战是所谓的“大数据技能差距”:使用这些数据集的研究项目需要不同的知识基础和技能集,以及不同于传统小规模实验研究的技术和概念工具。 研究及文章来源 该研究由Ariel Rokem 和 Noah C. Benson共同完成,均为华盛顿大学 eScience Institut...

乳腺癌脑转移分析揭示人类EGFR2阳性疾病中CDK12结构重排的富集

脑转移性乳腺癌中的CDK12结构重排富集现象研究报告 研究背景与目的 乳腺癌(Breast Cancer,BC)是涉及中枢神经系统(Central Nervous System,CNS)的第二常见实体肿瘤。脑转移性乳腺癌(Breast Cancer Brain Metastases,BCBMs)在患有转移性乳腺癌的患者中越来越常见。活跃的脑转移患者通常被排除在临床试验之外,使得这一领域在临床研究方面处于劣势。下一代测序(Next-Generation Sequencing,NGS)技术的应用使得人们能够对脑转移癌进行表征,并与原发性肿瘤进行比较,从而揭示其基因组差异。此外,以前的研究已经表明BCBMs中存在与免疫检查点和聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)抑制剂相关的基因改变和基因组特征,提...

用于脑肿瘤切除的基于机器学习的定量高光谱图像引导

用于脑肿瘤切除的基于机器学习的定量高光谱图像引导

机器学习辅助的定量高光谱成像在脑肿瘤切除中的指导作用研究 背景介绍 恶性胶质瘤的完全切除一直受到肿瘤细胞在浸润区难以区分的挑战。这项研究的背景是:在神经外科手术中,通过使用5-氨基乙酰丙酸(5-aminolevulinic acid,简称5-ALA),可以实现原卟啉IX(protoporphyrin IX,简称PPIX)的荧光引导,从而提高肿瘤的切除率。然而,即使在光谱成像的帮助下,许多低级别胶质瘤和一些高级别肿瘤由于PPIX的低积累,显示出较弱的荧光,这使得肿瘤更难区分。因此,了解不同类别肿瘤组织中的PPIX发射光谱,以及如何利用这些光谱进行分类,具有重要意义。 论文来源 这篇论文发表于《Communications Medicine》期刊(2024年),文章标题为“Towards mac...

系统炎症的中介作用和种族化在痴呆发病率差异中的调节作用

系统性炎症在认知病发病率差异中的中介作用及种族化的调节作用 本研究探讨了系统性种族主义与认知病负担增加之间的联系。研究人员考察了C-反应蛋白(CRP)作为系统性炎症标志物在暴露于种族主义和认知病发病率差异之间的中介作用及种族化过程的调节作用。通过美国健康和退休研究(样本为6,908人),研究人员在基线时(2006年、2008年)测量了血清CRP,并在六年的随访中通过认知测试对认知病的分类。自我报告的种族化类别被用作暴露于种族化过程的代理。研究分解了认知病发病率中非西班牙裔黑人和/或西班牙裔与非西班牙裔白人之间的差异,包括1) CRP的中介效应,2) 与种族化群体身份和CRP交互作用归因的调节部分,和3) 控制直接效应(种族主义作用的其他途径)。 结果显示六年发病率为12%。在被视为少数群体的...

人类中脑的单核配对多组学分析揭示了与年龄和帕金森病相关的胶质细胞变化

人类中脑的单核配对多组学分析揭示了与年龄和帕金森病相关的胶质细胞变化

单核多组学分析揭示人类中脑的年龄相关和帕金森病相关的神经胶质细胞变化 研究背景 年龄是帕金森病(Parkinson’s Disease, PD)的主要风险因素之一。虽然已知年龄在PD发病中的重要作用,但有关年龄如何改变大脑的基因表达和调控景观的细节仍不清楚。现有的大部分研究集中在转录组学的分析或遗传因素的探索上,但缺少关于人类中脑不同细胞类型在老化和PD病程中基因表达和染色质可及性变化的详细数据。因此,本研究通过多组学手段,采用单核分析技术,揭示了年轻、年老及PD患者中脑的基因表达和染色质可及性变化,以理解老化在PD发病中的作用。 论文来源 本篇研究论文发表于《Nature Aging》期刊,题为“一种对人类中脑的单核配对多组学分析揭示了与年龄和帕金森病相关的神经胶质细胞变化”。论文的作者包...

地中海饮食与肠道微生物群及青少年发病型多发性硬化症的三变量分析关联

研究报告:地中海饮食与肠道微生物群及青少年发病的多发性硬化症的三元分析 研究背景 多发性硬化症(MS)是一种自身免疫性疾病,其中免疫系统攻击神经细胞的保护层。大量研究表明,环境风险因素,如低维生素D状态和感染EB病毒,与MS有关。但这些因素单独并不足以导致MS,可能依赖于其他因素。近年来,人们对饮食和肠道微生物群之间的相互作用产生了浓厚兴趣,特别是在MS的背景下,因为这些因素可以表现出免疫调节和神经保护作用。尤其是地中海饮食,在普通人群中已被广泛证明与更好的健康结果相关,包括降低死亡风险和患多种慢性病的风险。 研究来源 该研究由Ali I. Mirza、Feng Zhu等人撰写,涉及多个机构,包括University of British Columbia、Simon Fraser Univ...

单核测序揭示对ALS敏感的神经元中存在遗传风险因子的丰富表达

《Nature Aging》发表ALS神经变性新研究 人类历史长河中,诸多神秘的疾病一直是科学研究的难题,其中,肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS)作为一种进行性神经退行性疾病,以肌肉功能的逐渐丧失及失能而著称。不幸的是,这场争夺生命线的斗争,病患常在症状发现的2至5年内败下阵来。关于ALS病因的探索,早已成为现代神经科学研究的重要领域。 如今,在这场抗击神经退行性疾病的征途上,一项新的研究成果展现在了世人面前。2024年7月,《Nature Aging》杂志发表了一篇由凯文·伊根(Kevin Eggan)和团队撰写的研究文章,此次研究的核心在于单核测序技术,该技术揭示了在ALS病患中,特定的外大脑神经元在退行性病变中显得异常敏感,并富集了遗传风险因子的表达。 研究背景与意义 ALS,俗称渐冻人...

部分重编程在老年神经发生区恢复神经祖细胞

科学研究报道 背景介绍 长期以来,衰老被认为是一个不可逆的过程,但近年来的研究表明,衰老其实是一个可以调控的生物过程。多种干预措施已被证明可以延缓甚至逆转某些衰老特征,部分重编程(partial reprogramming)是一种通过脉冲表达重编程转录因子(如Oct4、Sox2、Klf4、c-Myc即‘OSKM’),将体细胞逆转为类似胚胎干细胞状态的方法。该方法已在体外证明可以抹去许多衰老特征。然而,在体内应用时,完全重编程会导致细胞身份丧失和增加肿瘤发生的风险,因此更有前景的方法是通过控制重编程因子的表达实现“部分重编程”。部分重编程已在多个研究中显示出对老鼠组织功能的改善效果,但其对老龄大脑的影响仍然知之甚少。 论文来源 这项研究由Stanford University的Departme...

《遵循行星健康饮食与认知衰退的联系:来自ELSA-Brasil研究的发现》

在全球范围内,地球健康饮食(Planetary Health Diet)被提议为一种提高人类健康同时又能保护地球的食谱。然而,关于地球健康饮食与认知衰退关系的研究却十分有限。为了补充这项研究空白,Natalia Gomes Gonçalves、Leandro Teixeira Cacau、Naomi Vidal Ferreira、Paulo Andrade Lotufo、Alessandra Carvalho Goulart、Maria Carmen Viana、Sandhi Maria Barreto、Isabela Martins Bensenor、Dirce Maria Marchioni 和 Claudia Kimie Suemoto 等研究人员进行了相关研究,试图揭示地球健康饮食与...

GDF1缓解由听力损失引起的认知功能障碍

听力损失诱导认知障碍的改善 背景介绍 阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease, AD)是一种常见的痴呆症,其病理特征包括由淀粉样β(Amyloid β, Aβ)聚集形成的细胞外老人斑和由聚集tau蛋白形成的细胞内神经纤维缠结。流行病学研究表明,听力损失与痴呆症的发生密切相关,并且其风险显著增加。然而,关于听力损失如何促进AD发生的分子机制尚不明确。基于此,本研究旨在探讨听力损失与认知障碍之间的关系,并探索潜在的治疗靶点。 研究来源 本文《GDF1 Ameliorates Cognitive Impairment Induced by Hearing Loss》发表于《Nature Aging》2024年4月,由武汉大学人民医院神经内科、武汉大学中南医院神经内科、华中科技大学同济...