细胞命运决定机制的组学观点 背景介绍 在哺乳动物早期胚胎发育过程中，一个全能的合子（zygote）经过数次细胞分裂和两轮细胞命运决定（cell fate determination），最终形成成熟的囊胚（blastocyst）。在此过程中，随着胚胎的压缩，顶-基细胞极性（apicobasal cell polarity）的确立破坏了胚胎的对称性并指导了后续的细胞命运选择。内细胞团（inner cell mass，ICM）和滋养外胚层（trophectoderm, TE）的谱系分离是细胞分化的第一个标志，但一些分子已被证明在更早的阶段（如2-细胞和4-细胞阶段）通过细胞间的变异（inter-cellular variations）偏向早期细胞命运。 揭示早期细胞命运决定的机制已成为一个重要的研...
T2T-YAO：汉族全长双倍体参考基因组的组装实现 科学背景 人类基因组计划（Human Genome Project, HGP）自发起三十年以来，生物医学研究领域设定了一个长期目标，即构建完整而精确的人类参考基因组。然而，受限于测序技术的局限性，长期以来难以达到这个目标所需的全面性和精确度。近年来，随着测序技术的突破，T2T（Telomere-to-Telomere，端粒到端粒）项目公布了第一个全长单倍体人类基因组，即T2T-CHM13v1.1。这一成果填补了8%先前未知的高重复区域，使基因组质量达到了Q73.94，即每24.8兆碱基一次错误。 然而，即使这一成就令人振奋，T2T-CHM13基因组并不是真实人类个体的代表，而是源于一个缺失Y染色体的完全葡萄胎（CHM）细胞系的单倍体基因组。...
衰老引起的 trnaGlu-衍生片段通过靶向线粒体翻译依赖的嵴组织破坏谷氨酸生物合成 学术背景介绍 线粒体嵴是线粒体内膜向内突出的结构，这些结构在衰老过程中会发生明显的形态变化。然而，导致这些变化的分子机制及其对脑衰老的贡献仍不清楚。维持线粒体嵴的超微结构对于存在于嵴中的呼吸酶正常功能至关重要，如果嵴结构受到破坏，内膜上的酶活性将会显著降低。谷氨酶（GLS）是位于嵴中的一种重要酶，负责催化谷氨酸的生成，维持神经元内环境的谷氨酸水平。谷氨酸作为最丰富的神经活性氨基酸及主要兴奋性神经递质，其水平在脑衰老过程中逐渐下降，并常伴随记忆衰退。 转运RNA衍生小RNA（tsRNAs）由成熟tRNA在各种压力下产生，并参与多种生理和病理过程。然而，tsRNAs在器官特异性中的功能和分子机制迄今尚未完全明确...
背景介绍 代谢功能紊乱相关脂肪性肝病（MAFLD），是一种全球范围内高发的慢性肝病，其患病率约为25%。尤其在肥胖和2型糖尿病人群中，MAFLD的发病率更高。MAFLD是一种复杂的系统性疾病，病程可从代谢功能相关单纯性脂肪肝（MAFL）进展到代谢功能相关脂肪性肝炎（MASH），并进一步发展为肝纤维化和肝细胞癌等严重病理状态。虽然一些药物如过氧化物酶体增殖激活受体（PPAR）激动剂、法尼醇X受体（FXR）激动剂、胰岛素增敏剂和胰高血糖素样肽1（GLP-1）类似物已进入临床试验阶段，但MAFLD目前仍无有效的被批准的治疗手段，因此，迫切需要寻找新的治疗途径。 本研究旨在探究胰岛素是否通过调节肝脏转酮糖酶（TKT）的表达来影响MAFLD的进展，并寻找潜在的治疗策略。TKT是戊糖磷酸途径中的关键酶，...
背景介绍 在现代社会中，代谢功能失调相关脂肪肝病（MASLD，previously NAFLD）是一种常见且严重的慢性肝脏疾病。然而，现有对其病理机制的了解还不完全，包括其进展至代谢功能失调相关脂肪性肝炎（MASH）、肝纤维化及其实质病态生理过程。肝纤维化是MASH患者死亡及肝脏不良事件的主要预测因素，而其发生主要由于肝星状细胞（HSC）的激活。抑制HSC的激活对阻止和减少MASH的纤维化至关重要。 Hippo信号通路和TEAD1（transcriptional enhanced associate DNA-binding domain transcription factor 1）是现存研究发现与多种疾病如炎症、纤维化和癌症密切相关的因子。然而，TEAD1如何在肝星状细胞中扮演角色尚未有深...
GLP-1R在T细胞中的作用及其抗移植免疫和抗肿瘤免疫的调节机制 学术背景 胰高血糖素样肽-1受体（GLP-1R）已知是葡萄糖代谢的关键调节器，主要在胰腺β细胞中表达。过去的研究已经明确，GLP-1R激动剂在减少严重糖尿病并发症，如心血管事件和糖尿病肾病方面具有显著效果。然而，越来越多的文献表明GLP-1R可能在调节免疫系统中也扮演重要角色。例如，其mRNA在多个免疫细胞群体中表达，包括树突状细胞和T淋巴细胞，但其具体免疫功能尚未完全清楚。本研究的目的是深入探讨GLP-1R在T淋巴细胞中的角色，特别是在移植免疫和肿瘤免疫中的作用。 研究来源 这篇研究论文由Moufida Ben Nasr、Vera Usuelli、Sergio Dellepiane等多位科学家共同撰写，该团队的研究人员分别来...
背景介绍 胰腺导管腺癌（Pancreatic Ductal Adenocarcinoma，PDAC）是一种具有高度免疫抑制性肿瘤微环境（Tumor Microenvironment，TME）的恶性肿瘤，对免疫检查点抑制（Immune Checkpoint Blockade，ICB）治疗具有较强的抵抗力，例如抗PD-1和抗CTLA-4治疗。肿瘤来源的髓源性抑制细胞（Myeloid-Derived Suppressor Cells，MDSCs）在肿瘤免疫抑制中起着关键作用，并导致包括PDAC在内的癌症的ICB抵抗。揭示这种免疫抑制机制将为增加ICB治疗效果提供新的策略。生物喋呤（Biopterin）代谢影响肿瘤的免疫环境，而生物喋呤代谢途径中关键酶二氢蝶呤还原酶（QDPR）的缺乏可能会造成ICB...
抑制乙酰辅酶A羧化酶改善肿瘤浸润的CD8+ T细胞的抗肿瘤免疫能力 背景和研究目的 近年来，肿瘤微环境（Tumor Microenvironment, TME）的代谢变化对肿瘤浸润T细胞（Tumor-Infiltrating Lymphocytes, TILs）功能的影响成为免疫学研究的热点。尽管T细胞具有强大的抗肿瘤能力，但在TME中，其功能往往被削弱，从而限制了其抑制癌症的能力。这种功能丧失的主要原因之一是TME中营养资源的匮乏，导致肿瘤细胞与免疫细胞竞争营养物质，尤其是葡萄糖。本文旨在研究TME中乙酰辅酶A羧化酶（Acetyl-CoA Carboxylase, ACC）在CD8+ TILs中如何调控脂质利用，从而探讨限制ACC是否能通过增强脂肪酸氧化（Fatty Acid Oxidat...
背景介绍 胶质母细胞瘤（GBM）是一种成人中最常见和侵袭性最强的恶性原发性脑肿瘤，其具有较高的复发率和致死率。尽管在手术后进行积极的化疗和放疗，GBM仍然对现有的治疗方案不敏感，患者的预后通常很差。近年研究表明，胶质母细胞干细胞（GSCs）的存在显著增加了肿瘤的治疗耐药性和复发几率。针对这些细胞的特异性标志物的缺乏限制了靶向治疗的开发。因此，研究GBM代谢重编程所引发的治疗耐药机制并开发相关的靶向疗法，预计将提高肿瘤对化疗和放疗的敏感性，从而延长患者的生存期。 研究来源 本文的研究由Guanzhang Li等人领导，作者所属单位包括北京天坛医院、首都医科大学北京神经外科研究所、Otto von Guericke Universit？t Magdeburg等。该论文于2024年8月6日发表在《...
背景介绍 这篇论文旨在探讨肝硬化中的体细胞PKD1突变的功能及其在不诱发癌症的前提下对肝脏健康的影响。作者开展这项研究的原因在于，尽管体细胞突变在非恶性组织中积累并随着年龄增长而增加，但还不清楚这些突变克隆是否对器官健康有益。论文试图解答一个关键问题：这些突变克隆在损伤后的肝脏中是如何选择适应和修复组织，同时不促进癌症发展的。 论文来源 这篇论文的主要作者包括Min Zhu、Yunguan Wang、Tianshi Lu等，作者隶属于德克萨斯大学西南医学中心以及其它相关研究机构。这篇论文于2024年8月6日发表在《Cell Metabolism》期刊上，且所有权由Elsevier公司保留。 研究详细流程 a) 研究流程 该研究包含多个步骤，包括超深度靶向测序、肝硬化模型的创建、不同突变模型的...