脑胶质母细胞瘤中的PDGFRA, KIT和KDR基因扩增：异质性及其临床意义 学术背景 脑胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤，其异质性导致治疗上的重大挑战。GBM不仅在不同患者之间(异质性)，同一个肿瘤内部也表现出细胞遗传和表型上的多样性（同质性和间质性）。这种异质性是固体肿瘤治疗发展中的重大障碍，使得GBM具有高度的治疗抵抗力和侵袭性。此外，肿瘤内异质性表现为多个亚克隆的共存，这些亚克隆可以以互相混杂或空间分离的形式存在。肿瘤异质性在基因、分子和细胞特征上表现为不同的遗传、分子和形态学表现模式，这些因素都在肿瘤进展和治疗抵抗中起关键作用。 研究来源 本文由Bianca Soares Carlotto等人撰写，作者分别来自巴西的Universid...
炎症小体激活在缺血条件下调节星形胶质细胞的凋亡和焦亡 引言 缺血性中风是导致大脑损伤的主要机制之一，其特征是局部大脑区域因为血流中断而缺氧和缺乏能量。近年来，研究发现炎症反应在缺血性中风中发挥了关键作用。炎症小体（inflammasome）是细胞内多聚蛋白复合物，主要通过激活促炎性半胱氨酸蛋白酶（caspase）并促进促炎性细胞因子如IL-1β和IL-18的成熟和分泌，来驱动炎症反应。目前，大量研究已经确定了炎症小体在缺血性中风引起的神经细胞死亡以及小胶质细胞激活和细胞死亡中的作用，但在星形胶质细胞中的调控机制仍然知之甚少。 研究背景与动机 在中枢神经系统（CNS）中，星形胶质细胞是最丰富的胶质细胞类型，主要分为纤维性星形胶质细胞和原浆性星形胶质细胞。纤维性星形胶质细胞主要位于脑和脊髓的白质...
AIFM1基因错义变异导致线粒体功能障碍与核黄素缺乏不耐受 研究背景 线粒体是具双膜结构的细胞器，存在于有核真核细胞中，主要通过氧化磷酸化产生三磷酸腺苷（ATP）来提供细胞能量。线粒体拥有自己的基因组，编码着参与线粒体呼吸链复合物的13种蛋白质，其他线粒体蛋白则由核基因组编码并被导入到线粒体。其中，凋亡诱导因子（Apoptosis-Inducing Factor, AIFM1）是一种由X连锁AIFM1基因编码的线粒体黄素蛋白，参与无胱天蛋白酶的细胞死亡，并调控呼吸链复合物的生物合成。 研究表明，AIFM1基因的突变与多种临床表型相关，但核黄素（即维生素B2）治疗的效果仍存在争议。本研究旨在探索AIFM1基因c.1019T > C变异导致线粒体功能障碍的机制，并评估核黄素补充对该变异的影响。 ...
质量保证在未来高级测序诊断中的应用 背景介绍 过去十年中，下一代测序（Next-Generation Sequencing，NGS）在诊断稀有神经病（Rare Neurological Diseases，RND）领域取得了革命性进展。然而，技术、解释和报告标准的缺乏给确保全球一致和高质量的诊断带来了挑战。为了应对这一问题，欧洲稀有神经疾病参考网络（European Reference Network for Rare Neurological Diseases，ERN-RND）与欧洲分子遗传学质量网络（European Molecular Genetics Quality Network，EMQN）合作，建立了一个基于NGS的外部质量评估方案用于RNDs的诊断。 在21世纪，NGS方法逐渐成...
基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性 背景介绍 在遗传性乳腺癌（Breast Cancer, BC）的预测中，多基因风险评分（Polygenic Risk Scores, PRSs）正在日益广泛地应用，作为个体风险预测的一个重要工具。PRS的计算依赖于精确再现变异等位基因频率（Allele Frequencies, AFs），从而准确地预测PRSS的值。然而，目前使用下一代测序技术（Next-Generation Sequencing, NGS）进行多基因风险评分基因型分析时，存在不少技术上的限制。本研究的背景在于这些技术挑战，对改进和优化乳腺癌风险评估模型具有重要意义。 研究来源及作者背景 本研究由来自德国遗传性乳腺癌和卵巢癌联盟（German Consortium for...
通过计算方法提高对PAX6基因错义变异的解释 背景介绍 PAX6基因是一种高度保守的转录因子，在眼睛发育中起着重要作用。PAX6的杂合失功能变异可导致一系列眼科疾病，包括无虹膜症。然而，许多PAX6基因的错义变异目前被分类为不确定意义的变异（VUS），这对分子诊断提出了重大挑战。虽然计算工具可以用来评估基因变异的影响，但其预测的准确性有所不同。在这项研究中，作者们评估和优化了计算预测工具在PAX6错义变异方面的性能。 来源介绍 这篇文章由Nadya S. Andhika、Susmito Biswas、Claire Hardcastle等人完成，来自曼彻斯特大学生物科学学院进化、感染与基因组学研究所，曼彻斯特大学附属NHS基金会信托，欧洲分子生物学实验室（EMBL-EBI）等多个机构。这篇论文...
结构变异检测及在6224个未解决的罕见病外显子中的临床解释 研究背景 罕见病的诊断与研究一直是遗传学和临床医学的重要挑战。结构变异（SVs），包括大片段缺失、重复、倒位、易位以及更复杂的事件，均可能破坏基因功能，导致罕见疾病。然而，目前的外显子测序（ES）在处理小体内变异如单核苷酸变异（SNVs）和短于50个碱基对的插入-缺失（indels）方面的分析流程，对于SVs则尚不成熟。本研究旨在提高诊断率，尤其是通过检测和解释ES数据中的SV来解决尚未诊断出的罕见病病例。 研究来源 本研究由German Demidov, Steven Laurie等人联合完成，涉及来自不同研究机构的专家学者共同努力。文章发表于2024年在《European Journal of Human Genetics》上，...
荷兰药理遗传学工作组抗癫痫药物CYP2C9、HLA-A和HLA-B基因-药物相互作用指南 背景介绍 药理遗传学（Pharmacogenetics, PGx）研究基因变异如何影响个体药物反应，其目的是利用这些知识指导药物选择和剂量，优化药物治疗，预防药物不良反应，达到更安全和更具成本效益的药物治疗效果。尽管药理遗传学在全球医疗领域已有广泛认识，但其在日常临床实践中的应用仍面临挑战。 为了帮助临床医师实施药理遗传学，荷兰皇家药剂师协会（KNMP）于2005年成立了荷兰药理遗传学工作组（DPWG）。DPWG的目标是基于系统文献回顾开发药理遗传学指导剂量推荐，并将这些推荐整合到计算机化的药物处方、分发和自动化药物监控系统中。DPWG指南的双重目的是提供翻译PGx检测结果为预测表型所需的信息，并为在本...
POT1肿瘤易感性研究：更广泛的相关恶性肿瘤谱及附加筛查计划的建议 研究背景 POT1（Protection of Telomeres Protein 1）蛋白是Shelterin端粒结合复合体的重要组成部分，负责调节端粒长度。一些POT1基因的病理性变异（PV）会导致端粒延长、基因组不稳定以及癌症风险增加。POT1肿瘤易感性综合症（POT1-TPD）遗传模式为常染色体显性，且渗透率未知。它与皮肤黑色素瘤、慢性淋巴细胞白血病、血管肉瘤和胶质瘤的风险增加有关。此项研究旨在描述与POT1-TPD相关的更宽广的癌症表型。 研究来源 作者: Marta Baptista Freitas，Laurence Desmyter，Cindy Badoer，Guillaume Smits，Isabelle V...
Noonan综合征患者RAF1:c.770C>T p.(Ser257Leu)变异表型相关性研究报告 学术背景 Noonan综合征（Noonan syndrome, 简称NS）是最常见的RASopathy类疾病之一，这类疾病主要由于RAS蛋白和有丝分裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号转导通路的上调所致。这类疾病的特点包括面部畸形、先天性心脏缺陷（congenital heart defects, CHD）和肥厚型心肌病（hypertrophic cardiomyopathy, HCM）、生长障碍、骨骼和外胚层异常、淋巴系统发育不良、隐睾和神经发育迟缓/智力障碍（intellectual disability, ID）。 在NS患者中，肥厚型心肌病（HCM）是导致发病率和死亡率的主要因素。研究表明...