基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性

基于下一代测序的乳腺癌聚合风险评分位点基因分型局限性 背景介绍 在遗传性乳腺癌(Breast Cancer, BC)的预测中,多基因风险评分(Polygenic Risk Scores, PRSs)正在日益广泛地应用,作为个体风险预测的一个重要工具。PRS的计算依赖于精确再现变异等位基因频率(Allele Frequencies, AFs),从而准确地预测PRSS的值。然而,目前使用下一代测序技术(Next-Generation Sequencing, NGS)进行多基因风险评分基因型分析时,存在不少技术上的限制。本研究的背景在于这些技术挑战,对改进和优化乳腺癌风险评估模型具有重要意义。 研究来源及作者背景 本研究由来自德国遗传性乳腺癌和卵巢癌联盟(German Consortium for...

预防性药物基因组学检测对现实环境中抗血小板治疗的临床影响

药物基因组学检测对抗血小板治疗的临床影响 背景介绍 药物基因组学(PGx)正在改变P2Y12抑制剂(抗血小板药物)的使用,这类药物广泛应用于急性冠状动脉综合征(ACS)、神经血管问题及血管疾病的治疗。其中,氯吡格雷(clopidogrel)是一种常用的P2Y12抑制剂,这种前体药物依赖多种途径转化为活性代谢物,主要通过细胞色素P450 2C19(CYP2C19)酶来完成。然而,携带CYP2C19基因中功能缺失等位基因(LOF)的人群,其氯吡格雷药效较低,这使得某些患者面临更高的主要不良心血管事件(MACE)风险。 CYP2C19基因分型可以识别LOF等位基因的患者,并建议他们从氯吡格雷转到不依赖CYP2C19途径的替卡格雷(ticagrelor)或普拉格雷(prasugrel)。现有研究多集...

通过突变分析发现人类聚合酶δ校对缺陷的隐性效应

通过突变分析发现人类聚合酶δ校对缺陷的隐性效应

人类Polymerase δ校对缺陷隐性效应的发现:通过对POLD1突变正常细胞及癌细胞的突变分析 背景介绍 DNA修复的破坏是导致遗传性癌症的主要机制之一。POLD1和POLE的外显子区域中的杂合致病变异会影响清除酶的校对活性,导致癌症易感综合症,表现为胃肠多发性息肉、结直肠癌、子宫内膜癌等增加风险。目前普遍的解释是,这些清除酶活性的丧失与癌症的发展是通过增加体细胞突变率产生联系。然而,关于这一假设的具体验证仍存在争议,研究者通过分析一个携带POLD1突变家族成员派生的成纤维细胞克隆和亲子间的新生突变来探索这一问题。 论文来源 本研究由Maria A. Andrianova、Vladimir B. Seplyarskiy、Mariona Terradas等人完成,他们来自于Institut...

临床基因组测序中偶然发现的评估与报告框架

临床基因检测中偶然发现的评估与报告框架 研究背景 在当前临床实践中,全基因组测序(clinical genome sequencing, CGS)逐渐成为诊断罕见遗传性疾病的重要手段。然而,基因组测序中常常会遇到意外发现(incidental findings, IFs),即与检测目的无关的意外结果。由于缺乏普遍接受的指南来指导IFs的返回,IFs的报告政策参差不齐,缺乏透明度。因此,研究者们开发了一套新的框架,用于指导在CGS过程中遇到的IFs的评估和返回。该框架重点关注IFs的临床意义和可操作性,并提出了分步方法和中止点,以推荐是否返回IFs。 论文来源 本文由Carolyn M. Brown、Laura M. Amendola、Anjana Chandrasekhar等多位研究者共同完...

Mowat-Wilson综合症的DNA甲基化特征识别

识别Mowat-Wilson综合征的DNA甲基化特征 背景介绍 Mowat-Wilson综合征(MOWS)是一种罕见的神经发育障碍,由ZEB2基因的杂合性缺失或功能丧失突变引起。该基因编码一种转录因子,参与神经发育。患有MOWS的个体常表现出中度到重度的全球发育延迟、智力障碍、癫痫和典型的面部表型。此外,还可能存在短身材、Hirschsprung病、大脑和心脏异常等。然而,该综合征的罕见性和表型多样性使得其在新生儿期的诊断更具挑战性。为了解决这一问题,科研人员开展了研究,旨在通过识别一种新的诊断生物标志物来简化MOWS的诊断过程。 论文来源 这项研究由Stefano Giuseppe Caraffi、Liselot van der Laan、Kathleen Rooney等科研人员共同完成,...

血浆中脑源性外泌体circRNA作为急性缺血性脑卒中诊断标志物

脑源性外泌体环状RNA在血浆中作为急性缺血性脑卒中的诊断生物标志物 急性缺血性卒中(AIS),通常被称为中风,是一种严重的疾病,其特征是血流中断进入大脑,导致组织损伤和神经功能缺失。早期诊断对于有效的干预和管理至关重要,因为及时治疗可以显著改善患者的预后。因此,急需开发用于早期诊断AIS的新方法。多项研究表明,外泌体中包含的生物活性分子,尤其是环状RNA(circRNA),可以作为多种疾病的理想标志物。然而,关于外泌体及其circRNA对AIS发展和预后的研究较为稀少。因此,本文旨在探索使用血浆脑源性外泌体中的circRNA作为AIS的生物标志物的可行性。 研究背景 AIS是全球致残和死亡的主要原因之一。据统计,每年因急性缺血性卒中导致的死亡和长期残疾人数相当庞大。目前临床上急性缺血性卒中的...

围手术期IL8和IL18水平与术后三个月基底核萎缩有关

围术期IL8和IL18水平与手术后三个月大脑基底核萎缩的关联性研究 背景介绍 近年来,越来越多的研究表明,外科手术后可能加速大脑萎缩。同时,系统性炎症与神经退行性疾病之间的关系也备受关注。本研究假设术后的白细胞介素(Interleukin,简称IL)水平以及围术期IL水平变化可能与术后大脑基底核(Nucleus Basalis Magnocellularis,简称NBM)的萎缩有关。NBM是大脑皮层乙酰胆碱的主要来源。以往研究已经观察到,手术后大脑皮层厚度可能减小,心室扩大利及海马体萎缩的加剧,但这些研究并没有提供围术期炎症参数的具体数据。 论文来源 本文的研究来自于《Journal of Neuroimmune Pharmacology》杂志2024年第19卷第10期。论文的主要作者包括M...

中性粒细胞通过靶向Siglec-G破坏B-1a细胞稳态从而加剧脓毒症

研究报告:中性粒细胞通过靶向Siglec-G破坏B-1a细胞的稳态,加剧败血症 背景介绍 败血症是由感染引起的失调性免疫反应导致的威胁生命的器官功能障碍。伴随败血症的免疫系统功能障碍主要由病原相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns,PAMPs)和损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMPs)触发,导致了机体过度的炎症状态。B淋巴细胞主要分为两大亚群:B-1细胞和B-2细胞。小鼠B-1细胞进一步分为CD5+ B-1a细胞和CD5- B-1b细胞。B-1a细胞是重要的天然免疫细胞,通过分泌天然IgM抗体和IL-10在组织稳态和宿主防御中发挥重要作用。 在败血症中,腹腔内的B-1a细胞数量...

创伤性脑损伤中sgp130的使用对认知表现和化学因子水平的影响

研究综述:通过选择性抑制IL-6转导途径治疗创伤性脑损伤 背景 创伤性脑损伤(TBI)是全球范围内导致长期神经系统损伤和死亡的主要原因之一,目前缺乏有效的疾病调节治疗方法。TBI患者通常会遭受认知、行为和感觉缺陷,这可能与慢性、不受控制的炎症相关。研究表明,IL-6(一种多效性炎症调节剂)的急性和慢性上调与严重TBI患者在六个月后的全球预后较差相关。 研究来源 Gober等人的这篇论文发表于《Journal of Neuroinflammation》杂志。这项研究由Amy K. Wagner等研究人员主导,他们隶属于匹兹堡大学医学院的多个部门,包括物理医学与康复部、神经科学中心和Translational Science Institute等。本篇文章开放获取,依据Creative Comm...

生长相关蛋白43和基于张量的形态测量指标在轻度认知障碍中的变化

生长相关蛋白43和基于张量的形态测量指标在轻度认知障碍中的变化研究 研究背景 阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种全球性广泛存在的神经退行性疾病,其发病率在未来几年内可能会显著增加(Esquerda-Canals et al., 2017)。该疾病主要表现为近期记忆形成的缺陷,随后会逐步导致行为和认知的改变(Soria Lopez et al., 2019)。AD在诊断时已经导致大脑多个区域显著神经元损失和神经损伤(Mantzavinos & Alexiou, 2017)。具体表现为大脑某些区域的退变,如时间与顶叶,前额叶皮质和扣带回等(Wenk, 2003)。在AD中,大脑区域的神经节神经元数量减少,神经元轴突损伤和突触功能障碍与阿尔茨海默病的进展有关(Ma...