单细胞RNA测序和机器学习揭示CD8+ T细胞与葡萄膜黑色素瘤转移的关系

2024年发表在《Cancer Cell International》上的《Machine Learning and Single-cell RNA Sequencing Reveal Relationship Between Intratumor CD8+ T Cells and Uveal Melanoma Metastasis》的学术报告 研究背景及目的 葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma, UM)是成人最常见的眼内恶性肿瘤。在接受放射治疗或手术治疗后,原发性UM的局部复发率较低。然而,约40%的患者在治疗后会出现远端转移,特别是在肝脏,导致高达50%的死亡率(4至5年内)。当前,针对UM转移风险的评估主要依赖多基因模型,这些模型多采用机器学习方法,基于基因表达谱(Gene ...

靶向HSP90AB1和PARP1增强前列腺癌的抗癌治疗效果

前列腺癌细胞中 HSP90AB1 和 PARP1 协同靶向抑制的治疗潜力:Celastrol 与 Olaparib 组合治疗的研究综述 背景介绍 前列腺癌(Prostate Cancer, PCA)是全球男性中常见的恶性肿瘤之一,近年来发病率不断上升,对此类癌症的早期筛查和治疗手段显得尤为关键。前列腺癌的发病原因和病理表现较为复杂,涉及多种基因、环境和生活方式因素的共同作用。然而,尽管在检测和治疗方面取得了一些进展,前列腺癌依然面临较高的复发率和较差的生存预期,特别是在出现去势抵抗的晚期前列腺癌(Castration-Resistant Prostate Cancer, CRPC)患者中,治疗难度更大。现有的治疗手段,如雄激素剥夺疗法(Androgen Deprivation Therapy...

抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶对膀胱癌干细胞的凋亡诱导作用研究

膀胱癌(Bladder Cancer)是一种全球范围内高发的恶性肿瘤,在男性中位居常见恶性肿瘤的第四位。据中国国家癌症中心(NCCR)2016年的报告,膀胱癌在男性恶性肿瘤中的发病率排名第六。尽管医学诊断方法和手术方式不断改进,膀胱癌的复发率和进展情况仍未得到显著改善,其病理生理特性和生物学机制的认知不足,成为目前诊治的重大挑战。因此,研究膀胱癌的发生、复发和进展的生物机制具有重要意义,以期改善疾病的诊断、治疗和预后。 脂质代谢中的硬脂酰辅酶A去饱和酶(Stearoyl-CoA Desaturase, SCD)是近年来研究的重要靶点。SCD作为内质网的跨膜蛋白,在将饱和脂肪酸转化为单不饱和脂肪酸(MUFA)的过程中发挥重要作用。研究表明,MUFA在肿瘤中与增殖、侵袭和生存通路相关。硬脂酸是S...

erianin对胰腺癌的抗肿瘤作用及其机制研究

抗癌研究进展:Erianin对胰腺癌的抑制机制与作用 背景与研究意义 胰腺癌是一种消化道恶性肿瘤,因其早期症状不明显、恶性程度高,且常规放化疗效果有限,使其具有极高的致死率。据统计,全球胰腺癌的5年生存率不足10%,并预计在2030年将成为第二大致死癌症。由于治疗手段的限制,开发新的分子靶向药物成为当务之急。近年来,天然化合物Erianin(艾瑞宁)因其抗肿瘤活性在多种癌症治疗中崭露头角。本研究关注Erianin在胰腺癌中的抗癌活性及其潜在机制,旨在为胰腺癌患者提供新的治疗策略。 研究概述与方法 该研究由Ruxue Liu、Minghan Qiu、Xinxin Deng等研究人员合作完成,发表于《Cancer Cell International》期刊。文章通过网络药理学、体外细胞实验、RN...

MGA删除通过调控线粒体OXPHOS导致Richter转化

MGA 删除通过调节线粒体氧化磷酸化促进Richter转化 本篇文章主要围绕慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)转化为侵袭性淋巴瘤,即里希特转化(Richter’s Transformation,RT),探讨了MGA(Max基因关联)的功能和分子机制。MGA是一种功能性MYC抑制因子,在CLL中的突变率为3%,而在RT中则升高至36%。鉴于MGA突变在RT中的频繁出现,但其在CLL转化成RT过程中的具体作用和机制仍不明,本研究通过建立MGA基因敲除鼠来探索其在RT中的角色。 学术背景与研究目的 RT是CLL进展为侵袭性淋巴瘤的过程,主要转化为弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL),其预后...

神经景观与放射治疗患者的功能结果关联:口咽鳞状细胞癌的病例研究

研究放疗患者神经网络与咽癌功能结局的关联 1. 论文背景介绍 在人乳头状瘤病毒(HPV)介导的口咽鳞状细胞癌(OPSCC)发病率在过去40年中,特别是在预后良好的年轻人群中显著增加。然而,现行的治疗方式往往会导致一些不良反应,如吞咽困难(dysphagia)。尽管众多研究已经对吞咽困难进行了详细研究,但病人报告和功能性结局与神经变化之间的关联仍然是一个重要的研究空白。为了解决这个问题,本研究通过多重免疫荧光染色和机器学习技术,探讨了肿瘤相关的神经变化与病人报告和功能性结局的关联。 2. 来源和作者介绍 这篇论文由Shajedul Islam等人撰写,作者隶属于德克萨斯大学MD安德森癌症中心、贝勒医学院、密苏里大学医学院等机构。论文发表于2024年7月31日的《Science Translat...

颈部转移性淋巴结的自动分割方法:基于纵向MRI的自蒸馏掩码图像transformer

颈部转移性淋巴结的自动分割方法:基于纵向MRI的自蒸馏掩码图像transformer

自蒸馏的掩码图像transformer在纵向MRI中的潜力——自动分割颈部淋巴结转移 报告介绍 在肿瘤放疗中,自动分割技术承诺提升速度并降低手工分割带来的读者间差异。在放射肿瘤学临床实践中,精确快速的肿瘤分割对于患者的个性化治疗至关重要。Ramesh Paudyal等来自Memorial Sloan Kettering Cancer Center的研究人员开展了这一项研究,旨在实现并评估“屏蔽图像变压器”(masked image modeling using vision transformers,即SMIT)算法在口咽部鳞状细胞癌患者的纵向T2加权MRI图像中的颈部淋巴结转移的自动分割精度。 这篇论文发表在《BJR|Artificial Intelligence》2024年第1期。这项研...

小细胞肺癌的预后和治疗选择的蛋白质组学分层

小细胞肺癌的蛋白质组学分型:预后和治疗方案分析 研究背景 小细胞肺癌(Small Cell Lung Cancer, SCLC)是一种高度恶性且异质性强的癌症,其快速生长、早期转移及耐药性使得治疗手段有限,预后预测模型也有待改进。目前已知的基因组分析大多集中在TP53和RB1失活,这两种基因在超过98%的SCLC患者中出现异常。此外,PI3K/AKT/mTOR通路的基因突变也频繁出现。然而,SCLC的有效分型标志物和治疗靶点依然有限。这就导致尽管在过去几十年间进行了许多化疗方案和生物制剂的临床试验,但患者总生存率并未显著改善。当前的5年生存率约为20%-25%(局限期SCLC, LS-SCLC)和1%-2%(广泛期SCLC, ES-SCLC),使得SCLC成为最致命的癌症之一。 早期的细胞系...

癌症的酸碱平衡及其对表型行为的影响

癌症是全球关注的重要公共健康问题,其复杂的病理过程和多样的表现形式一直是研究的热点。许多研究已表明,酸碱平衡失调在癌症的发生和发展中起关键作用,但背后的机制尚未完全明了。在这篇题为《Acid–base homeostasis and implications to the phenotypic behaviors of cancer》的研究中,作者从系统生物学的角度出发,探讨了酸碱平衡与癌症表型行为之间的关系。 研究背景 酸碱平衡(acid-base homeostasis)是所有活细胞维持正常生理功能的重要特性。如果细胞内的pH值(简称phi)和细胞外的pH值(简称phe)长期失调,将会引发各种疾病。在这项研究中,作者旨在通过计算模型及转录组数据分析,解释癌症组织细胞内的pH值为何会呈碱性...

人类胎儿肝终末红细胞生成的全面表征和全球转录组分析

人类胎儿肝终末红细胞生成综合特征及全转录组分析 背景和问题 红细胞生成(Erythropoiesis)是红细胞生产的过程。起初在卵黄囊中发生“原始”红细胞生成,逐渐被胎儿肝脏(Fetal Liver, FL)和出生后骨髓(Bone Marrow, BM)中的“终末”红细胞生成取代。在人类胎儿发展过程中,FL 是关键的红细胞生成器官,但目前对人类 FL 红细胞生成的认识非常有限。本文的研究目的在于综合特征和全球转录组分析人类胎儿肝脏终末红细胞生成,探讨红细胞生成过程中的基因表达模式,并进一步理解培养系统对基因表达的影响。 研究来源 本文由Yongshuai Han, Shihui Wang, Yaomei Wang, Yumin Huang, Chengjie Gao, Xinhua Guo,...