数据工程赋能的胶质瘤生存分析

脑胶质瘤患者的生存分析研究:数据工程赋能综述 引言 脑胶质瘤是一种在胶质细胞中发生的肿瘤,它们占全部原发性脑和中央神经系统肿瘤的26.7%。由于肿瘤异质性的存在,脑胶质瘤患者的生存分析成为了临床管理中的一个关键任务。在过去几十年里,研究者们提出了多种生存分析方法,结合不同类型的数据,如影像和遗传信息。尤其是近年来,机器学习技术和深度学习的兴起改变了传统的基于统计分析的生存分析方法。本文综述了利用诊断影像技术和基因组平台获得的预后参数,以及用于预后预测的技术、学习和统计分析算法,突出了现有生存预测研究的挑战,并提出了该领域研究的未来方向。 作者及出版信息 作者: Navodini Wijethilake (斯里兰卡莫拉图瓦大学计算机科学与工程系研究成员) 合著者: Dulani Meedeni...

基于贝叶斯推断的个体化胶质瘤生长预测

利用贝叶斯推断进行个性化预测胶质瘤生长 引言 胶质母细胞瘤(glioblastoma)是最具侵袭性的原发性脑肿瘤,肿瘤细胞会高度侵袭周围组织。通过标准医学成像技术无法准确识别这些弥漫性肿瘤边界,导致临床干预效果不佳且预后较差。由于此类挑战,依靠医学图像进行肿瘤空间和时空发育的可靠计算预测能够提供更多信息,有助于医生为每个个体设计最佳治疗方案。 近年来,多个关于肿瘤生长的生物物理模型通过非侵入性成像测量数据进行了开发和校准,旨在预测未来的肿瘤生长和治疗结果。然而,要实现预测肿瘤发展,必须解决两个关键挑战:一是需要量化模型预测中的不确定性,以改善个体治疗效果;二是需要表征肿瘤和宿主组织的空间异质性,这会对治疗的设计产生显著影响。 研究背景和动机 本研究的核心动机在于通过引入贝叶斯框架来解决上述两...

嵌入TiO2-Au-MXene的矩形开放通道用于脑肿瘤诊断的PCF生物传感器的数值分析

数值分析嵌入TiO2-Au-MXene的矩形开放通道PCF生物传感器用于脑肿瘤诊断 学术背景与问题陈述 近年来,具有成本效益和高可靠性的生物传感器的开发成为一个研究热点。这些传感器旨在检测分析物的微小浓度,种类繁多,涵盖了各种技术,用于监测和检测细胞和液体。光子晶体(photonic crystals, PHCs)和PHC纤维(photonic crystal fibers, PCFs)因其紧凑尺寸、电磁干扰抵抗性、对分析物需求量少、结构设计灵活且易于集成等优点,迅速占据了传感器技术的热门选择。 特别值得注意的是,基于表面等离子体共振(surface plasmon resonance, SPR)的光纤生物传感器表现出色。SPR现象通过光纤和贵金属相结合,可以剧增检测灵敏度,尤其在生物医学领...

基于影像表型和基因型的深度学习来预测胶质母细胞瘤患者的总体生存时间

基于影像表型和基因型的深度学习来预测胶质母细胞瘤患者的总体生存时间

在全球范围内,恶性脑肿瘤中最常见和最致命的是胶质母细胞瘤(Glioblastoma, GBM)。近年来,不断有研究尝试通过机器学习技术,基于术前的单模态或多模态成像表型来预测GBM患者的总生存时间(Overall Survival, OS)。尽管这些机器学习方法在预测上取得了一定的进展,但多数研究并未考虑基于影像学的OS预测方法中包含的肿瘤基因型信息,而这些信息对预后有很强的指示作用。为解决这般问题,Tang Zhenyu、Xu Yuyun、Jin Lei 等人于2020年6月在《IEEE Transactions on Medical Imaging》上发表了题为“Deep Learning of Imaging Phenotype and Genotype for Predicting ...

基于时序纵向磁共振成像的胶质瘤生长建模及其占位效应研究

肿瘤生长数学模型研究——利用纵向磁共振成像探究胶质瘤的扩展 近日发表在《IEEE Transactions on Biomedical Engineering》上的一篇文章,对胶质瘤(glioma)的数学建模及生长规律进行了系统性研究。该研究由Birkan Tunç、David A. Hormuth II、George Biros和Thomas E. Yankeelov完成,主要通过纵向磁共振成像(MRI)数据评估三种不同数学模型在模拟肿瘤生长以及质量效应(mass effect)中的性能差异。 研究背景 胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme, GBM)是最常见的原发性脑肿瘤,患者预后较差。GBM一个显著的特征是对周围脑组织的严重变形效应,即“质量效应”,目前已有大量...

聚焦超声介导的大容量药物输送

比较声波模式和微泡给药策略在聚焦超声介导的血脑屏障大体积药物传递中的应用 背景介绍 弥漫性固有桥脑胶质瘤(Diffuse Intrinsic Pontine Glioma,DIPG)是儿童中最常见且最致命的脑干肿瘤。由于DIPG的血脑屏障(Blood-Brain Barrier,BBB)通常保持完整,致使药物无法有效穿透,这为治疗增加了巨大挑战。近年来,聚焦超声结合微泡介导的BBB打开(FUS-BBBO)技术显示出打破这一障碍的巨大潜力。考虑到DIPG的高扩散性,需要能够覆盖整个肿瘤区域的大体积FUS-BBBO治疗策略。本文的研究目标是确定一种能够在脑干部位实现高效且均匀的大体积BBBO的最优治疗策略,以实现免疫检查点抑制剂(如抗PD-L1抗体)在脑干部位的有效传递。 研究来源 该研究由Ya...

近红外窗口II荧光引导高等级胶质瘤手术延长患者无进展生存期

近红外窗口II荧光引导高等级胶质瘤手术延长患者无进展生存期

近红外窗口II荧光影像引导手术延长高级别胶质瘤患者的无进展生存期 研究背景 高级别胶质瘤(HGG)是中枢神经系统中最常见的恶性原发性肿瘤,其中胶质母细胞瘤(GBM)预后最差。为了改善GBM患者的治疗效果,提高术中肿瘤切除率,减少术后复发,研究者们开展了基于近红外窗口II(NIR-II)荧光影像的手术引导策略研究。NIR-II荧光影像具有组织自发荧光低、渗透深度大的特性,有望提高肿瘤切除的精确性与安全性。 论文信息 本项研究由夏晓静博士、张哲博士等人共同完成,他们分别隶属于中国科学院自动化研究所分子影像重点实验室等多个研究机构。研究成果发表在 IEEE Transactions on Biomedical Engineering (Vol. 69, No. 6, June 2022) 杂志上。...

磷酸肌酸促进通过稳定BRD2以促进胶质母细胞瘤生长的表观遗传重编程

由陈丽舒(Lishu Chen)、齐庆辉(Qinghui Qi)、姜晓庆(Xiaoqing Jiang)等多位科学家合作完成的研究成果在开创性的癌症发现(Cancer Discovery)杂志上发表,报道了磷酸肌酸(Phosphocreatine,PCr)如何通过稳定含溴结构域蛋白2(BRD2)来促进胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)的生长,这一发现为胶质母细胞瘤治疗提供了新的视角。 胶质母细胞瘤是最常见也是最致命的恶性脑肿瘤,其生存率非常低。尽管肿瘤的代谢重塑被认为是癌症的标志之一,但胶质母细胞瘤的特定代谢特征目前还未完全明了。研究者们发现,在GBM中存在一类具有自我更新能力的特殊细胞亚群,称为GBM干细胞(GSCs),它们对肿瘤的发展和对GBM治疗的抗性起着关键作用。最近的...

CHD2调控儿童神经胶质瘤细胞与神经元的相互作用

CHD2调控儿科胶质瘤中神经元-胶质瘤相互作用的研究报告 背景介绍 高等级胶质瘤(High-grade gliomas,HGG)是成人和儿科患者中致命的疾病。近年来研究表明,神经元活动能促进多种高等级胶质瘤亚群的进展。然而,调控这一过程的表观遗传机制尚不明确。本文报告了一种新的表观遗传调控机制,即染色质重塑因子Chromodomain Helicase DNA-binding Protein 2(CHD2)在以肿瘤相关H3.1K27M突变为特征的弥散性中线胶质瘤(Diffuse Midline Glioma,DMG)中调控神经元-胶质瘤相互作用的角色。 研究来源 这项研究由Xu Zhang、Shoufu Duan、Panagiota E. Apostolou等多位作者联合完成,来自Colum...

自体肿瘤浸润淋巴细胞单药治疗耐药晚期非小细胞肺癌患者的研究

自体肿瘤浸润淋巴细胞单药治疗耐药晚期非小细胞肺癌患者的研究

利福卢塞(Lifileucel)在对免疫检查点抑制剂耐药的晚期非小细胞肺癌患者中的应用 本文是由 Adam J. Schoenfeld 及众多顶尖学者共同撰写的,发表于《Cancer Discovery》杂志2024年版,该研究基于一项在多中心进行的第二阶段临床试验,旨在评估利福卢塞(Lifileucel,LN-145)这种自体肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)单药疗法在对免疫检查点抑制剂(ICI)耐药的转移性非小细胞肺癌(mNSCLC)患者中的疗效和安全性。 背景介绍 近年来,免疫治疗,包括免疫检查点抑制剂(ICI),在晚期非小细胞肺癌(NSCLC)治疗中显示出了显著疗效。然而,部分患者对ICI耐药,尤其是PD-L1(程序性死亡配体1)表达阴性、低肿瘤突变负荷(TMB)以及存在STK11突变的肿瘤...