科学报告：研究显示SMARCA4在B细胞淋巴瘤中的作用 背景介绍 在成熟B细胞转归和凋亡的过程中，胚系中心（Germinal Center, GC）发挥关键作用。GC反应是一个快速且短暂的免疫反应结构，通过体细胞突变和亲和力成熟过程提升B细胞特定抗原的亲和力，这是形成记忆B细胞和浆细胞的基础。然而，GC反应的不稳定和失控可能导致血液系统恶性肿瘤如B细胞淋巴瘤。因此，研究这些机制对理解和治疗淋巴瘤具有重要意义。 在众多基因突变中，SMARCA4是人类癌症中常见的突变基因之一，尤其在以GC为来源的Burkitt淋巴瘤中表现突出。本文的研究主要探讨了SMARCA4的部分丧失如何影响GC B细胞的发育及其在淋巴瘤发生中的作用。 研究来源 该研究由Qing Deng、Priya Lakra和Panho...
区域性细胞外基质瓦解和神经侵犯在胰腺癌中的肿瘤生物学基础 背景介绍 胰腺导管腺癌（Pancreatic Ductal Adenocarcinoma，PDAC）是最具侵袭性的癌症类型之一，其通常与高度纤维化的基质相关，基质可能占肿瘤质量的90%左右。尽管形态学异质性在常规病理报告中并未涉及，但其具有预后意义，指示潜在的肿瘤生物学。PDAC肿瘤内异质性在分子水平上通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了基因表达程序的多样性，且高表达异质性与较差的总体生存期相关。这提示肿瘤细胞的异质性可能使其快速适应治疗，或选择出具有侵略性和治疗抵抗性的肿瘤细胞。 然而，scRNA-seq并没有阐明基因表达程序与形态学模式之间的关系，限制了我们对与形态学异质性相关的分子电路的理解。为弥合这一知识鸿沟，本研...
关于癌症患者外周血免疫特征分析的研究报告 癌症是全球范围内重大且广泛存在的健康问题，尽管近年来在癌症治疗方面取得了显著进展，但依然有许多挑战亟待解决，包括如何准确预测患者对不同治疗的反应。免疫治疗，尤其是免疫检查点抑制剂（免疫检查点blockade，ICB）在过去十年中取得了显著进展，但大多数患者的反应率仍然难以预测，并且常常出现严重的免疫相关副作用。因此，全面诊断和一致性分析模型以评估患者免疫系统的状态，以监测治疗反应和预测是迫切需要的。 本文源头 这篇题为《comprehensive peripheral blood immunoprofiling reveals five immunotypes with immunotherapy response characteristics i...
肝癌体内异质性药物基因组学分析：基于大规模类器官生物库的研究报告 学术背景 原发性肝癌 (Primary Liver Cancer, PLC) 是全球癌症相关死亡的第三大原因，主要包括肝细胞癌 (Hepatocellular Carcinoma, HCC)、肝内胆管癌 (Intrahepatic Cholangiocarcinoma, ICC) 和一种混合型的肝细胞-胆管癌 (Combined Hepatocellular-Cholangiocarcinoma, CHC)。由于异质性的存在，原发性肝癌的精确治疗存在重大挑战。既往研究表明，肝癌不同区域的基因组异质性在很大程度上影响了药物的敏感性，导致治疗失败。 患者来源类器官 (Patient-Derived Organoids, PDOs)...
半监督超声视频中甲状腺结节检测的研究报告 研究背景 甲状腺结节是常见的甲状腺疾病，甲状腺结节的早期筛查和诊断通常依赖于超声检查，超声检查是一种常见的无创检测方法，可用于检测包括甲状腺结节、乳腺癌和动脉斑块在内的多种疾病。然而，由于甲状腺结节在超声图像中的分辨率低、病变形态不规则且复杂等原因，超声检查高度依赖放射科医生的经验，误诊和漏诊时有发生，特别是在欠发达地区和国家更为常见。因此，开发基于计算机辅助诊断（Computer-Aided Diagnosis，CAD）的自动化精准方法显得尤为重要。 近年来，深度学习技术被引入到超声图像的计算机辅助诊断中。尽管现有的甲状腺结节检测方法在静态超声图像上取得了一些进展，但这些方法未能充分利用诊断过程中随时间变化的空间和时间信息。在临床筛查和诊断过程中，...
使用算法控制电穿孔技术治疗自发性马黑色素瘤的安全性和有效性研究 近年来，电穿孔(irreversible electroporation, IRE)作为一种非热烧蚀技术，在肿瘤治疗方面展现了巨大的潜力。与传统的热烧蚀方法相比，IRE能够更好地保留细胞外基质和主要血管，最小化对周围组织的损害。然而，现阶段的电穿孔技术在实际应用中还存在一些挑战，尤其是如何有效控制治疗过程中温度的变化，以避免热损伤。这项研究正是基于以上背景，探索了使用算法控制电穿孔(Algorithmically Controlled Electroporation, ACE)治疗自发性马黑色素瘤的安全性和有效性。 研究来源 该研究由Christopher C. Fesmire、Ross A. Petrella、Robert W...
能够显示细胞外囊泡的抗体在靶向癌症治疗中的应用 外泌体（Extracellular Vesicles, EVs）作为天然的递送载体和生物信号的介导体在各类组织中的应用已有广泛研究。在本篇研究中，研究者借助EVs的这些特性，展示了一种装饰有特定抗体结合域（Fragment crystallizable，Fc）的EVs，其作为癌症靶向治疗的模块化递送系统。本文发表于《Nature Biomedical Engineering》，由一支国际合作团队完成，包括Oscar P. B. Wiklander, Doste R. Mamand, Dara K. Mohammad等人，他们分别来自Karolinska Institutet、Salahaddin University-Erbil以及Univer...
基于粪便血红蛋白浓度定制筛查间隔实现结直肠癌的精准筛查 研究者：Amy Ming-Fang Yen, 陈扬卿，丁玉林，邱文柱，邱翰摩，Tony Hsiu-Hsi Chen，Sam Li-Sheng Chen 学术背景 结直肠癌（CRC）是全球范围内第三大高发的恶性疾病。近年来，结直肠癌筛查在预防和早期检测方面取得了显著进展，这主要归功于实施了基于人口的筛查项目和治疗手段的进步。其中，粪便免疫化学测试（FIT）作为一种重要的粪便诊断工具，在降低CRC死亡率方面发挥了关键作用。尽管结直肠癌筛查已被证实有效，能通过结肠镜切除癌前腺瘤进行初级预防，并通过早期检测缓解结直肠癌相关的死亡率，但如何利用粪便中的生物标志物全面分类人口以进一步优化筛查方案仍需深入调查。 论文来源 本文由Amy Ming-Fa...
溶瘤矿化细菌可能通过局部注射用于肿瘤免疫治疗 研究背景 作为一种新的癌症治疗方法，基于细菌的癌症免疫治疗已经有悠久的历史，最早可以追溯到19世纪末，通过注射加热灭活的细菌治疗肉瘤。初步的试验发现这些细菌能够激发强烈的不特异性免疫应答并招募大量的杀伤细胞以对抗肿瘤细胞。然而，现代的研究表明，尽管这些类型的细菌（如Coley毒素）在20世纪被放疗和化疗取代，但其治疗效果与标准放疗和化疗相当。自20世纪90年代以来，研究发现卡介苗（BCG）作为一种减毒活菌，已经成为治疗膀胱癌的首选膀胱内免疫疗法。 近年来，许多研究组和生物技术公司投入了大量资源开发新的抗肿瘤溶瘤菌型，通常通过基因工程方法减少其毒性并赋予其额外的抗肿瘤能力。此外，细菌也被用于开发癌症疫苗，为细菌基治疗癌症免疫疗法提供新的机遇。值得注...
基于级联扩散模型从RNA测序数据生成肿瘤的合成全切片图像 近期发表在Nature Biomedical Engineering上的一篇题为”Generation of Synthetic Whole-Slide Image Tiles of Tumours from RNA-Sequencing Data via Cascaded Diffusion Models”的研究，引起了广泛关注。这项研究由来自斯坦福大学、根特大学、阿贡国家实验室等多家机构的学者共同完成，旨在解决癌症数据不足的问题，从而提升机器学习模型在癌症检测中的表现。本文的作者包括Francisco Carrillo-Perez, Marija Pizurica, Yuanning Zheng, Tarak Nath Nandi...